Comme tous les animaux, les cétacés sont exposés aux maladies et aux bio-toxines. Cependant le nombre de ces maladies augmente et on constate chez les cétacés l’apparition de nouvelles maladies. Certaines peuvent être transmises par l’Homme, d’autres sont le résultat de la pollution,…
Récemment on a constaté que des cétacés avaient été victimes de maladies qui ne concernaient que des animaux terrestres, voire même de maladies typiques d’animaux d’élevage.
L’augmentation et l’apparition de ces nouvelles maladies est d’autant plus problématique que le système immunitaire des cétacés peut être affaibli par la pollution (de plus en plus importante) du milieu marin. Ce problème est encore mal connu mais il devient préoccupant car ces maladies affaiblissent des animaux déjà confrontés à de multiples menaces.
La CBI a établi un groupe de travail sur les maladies émergentes et résurgentes des cétacés : le CERD ( Cetacean Emerging and Resurging Diseases ).